Mistras kapitalförvaltning ska avspegla det uppdrag som stiftelsen har, att bidra till lösandet av miljöproblem och att verka för en hållbar utveckling. Detta ska göras med rimlig avvägning mot kravet i stadgarna på god avkastning och begränsad risk. Inom branschen finns flera uttryck för kapitalförvaltning för hållbar utveckling. Mistra använder begreppet SRI - Social Responsible Investment i en vid tolkning. För Mistra innefattar begreppet SRI tre dimensioner - ekonomi, ekologi samt kulturella och social aspekter. Begreppet kan dock tolkas olika beroende på vem som använder det och vilken bakgrund man har.
Mistra valde att i ett inledande skede arbeta med uteslutningskriterier baserade på FN-avtal och av Sverige påskrivna konventioner, ILO, miljö- och barnkonventioner mm. Nu har fokus flyttats till att lägga tyngdpunkten på ett positivt urval där vi tillämpar modellen "bäst i klassen". Mistras förvaltare har olika metodik och grad av miljö- och etikinformation i sina förvaltningsmodeller. Mistra följer arbetet nära för att lära och kunna påverka den framtida kapitalförvaltningen.
När Mistra bildades 1994-01-01 startade stiftelsen med att kapital på 2,5 miljarder kronor. Medlen kom från de tidigare löntagarfonderna.
Startkapital januari 1994: 2,5 miljarder SEK
Kapital september 2009: 2,9 miljarder SEK
Ackumulerat utbetalat till forskning september 2009: 2,7 miljarder SEK
Per den 1 april 2007 är hela Mistras kapitalförvaltning placerad enligt hållbarhetskriterier. Därmed är målet om att senast 2007 förvalta hela portföljen enligt hållbarhetskriterier uppnått.
